分公司不行，子公司可以，因為分公司沒有資格單獨申請高新技術企業認定的資格，但是可以與總公司共同享受稅收優惠，子公司是具有獨立法人資格的，因此只要符合《高新技術企業認定管理辦法》中的相關要求，就可以單獨申請高新技術企業的認定，且成功認定后同樣能享受到稅收優惠。
已認定的高新技術企業有下列行為之一的，由認定機構取消其高新技術企業資格：
1、在申請認定過程中存在嚴重弄虛作假行為的；
2、發生重大安全、重大質量事故或有嚴重環境違法行為的；
3、未按期報告與認定條件有關重大變化情況，或累計兩年未填報年度發展情況報表的。
對被取消高新技術企業資格的企業，由認定機構通知稅務機關按《稅收征管法》及有關規定，追繳其自發生上述行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業稅收優惠。
第二十條 參與高新技術企業認定工作的各類機構和人員對所承擔的有關工作負有誠信、合規、保密義務。違反高新技術企業認定工作相關要求和紀律的，給予相應處理。
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