醫療器械經營許可證是醫療器械經營企業必須具備的證件，開辦第二類醫療器械經營企業，應當向省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門備案；開辦第三類醫療器械經營企業，應當經省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門審查批準，并發給《醫療器械經營企業許可證》。醫療器械經營許可證現為后置審批，工商行政管理部門發給營業執照后申請審批。《醫療器械經營企業許可證》有效期為5年。
網上辦理流程：1、申請人通過登錄政務服務網，提出注銷申請。2、上傳的申請材料齊全的，符合法定形式的應當受理。3、相關部門對資料進行審核并且做出審核決定。4、對審核材料予以受理的準予行政許可，不予以受理的作出不予受理說明書，材料不齊全的一次性告知企業需要補充的材料。5、相關部門公示辦理結果，并收回醫療器械經營許可證。
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